В 2003 году в отношении руководства издательства было возбуждено уголовное дело по факту лжепредпринимательства. Ещё в 2002 году на территории Ростовской области была задержана контрабандная книжная продукция, поступавшая на юг России от имени подставных фирм, фактически же реализацией книжной продукции занималось «Эксмо». Такая схема позволяла уклоняться от уплаты налогов. Следствие длилось около трех месяцев. Был «найден руководитель преступной группы — бывший сотрудник „ЭКСМО“,.. [и] объявлен в розыск… Сейчас в связи с этим дело приостановлено».